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- Área de Arte 5
- Cátedra Unesco sobre Inclusión Social y Académica para Personas con Discapacidad y Necesidades Educativas Especiales 3
- Centro de Estudios e Intervención de la Conducta (CESIC) 1
- Centro de Investigaciones y de Estudios Sociales (CIES) 3
- Centro de Investigación en Biomateriales y Odontología (CIBO) 22
- Centro de Recursos para el Aprendizaje y la Investigación (CRAI) 1
- Decanato de Innovación Educativa 3
- Decanato de Investigación e Innovación (DII) 24
- Departamento de Estudios Generales 2
- Dirección de Tecnología de la Información y la Comunicación 2
- Escuela de Graduados 1
- Facultad de Ciencias Básicas y Tecnológicas 19
- Facultad de Ciencias de la Salud 229
- Facultad de Ciencias Económicas y Sociales 22
- Instituto de Diseño para los Trópicos (IDT) 5
- Instituto de Investigación en Neurociencias Aplicadas (INA) [anteriormente Laboratorio de Neurocognición y Psicofisiología, NEUROLAB] 11
- Instituto de Medicina Tropical y Salud Global (IMTSAG) 98
- Unidad de Atención a Niños, Niñas y Adolescentes en Situación de Violencia (UAV) 2
- Universidad Iberoamericana (UNIBE) 3
- Vicerrectoría Académica 3